汉献帝时，曹操独揽朝政大权，挟天子以令诸侯。一次，曹操率领大军南征刘备、孙权，孔融（孔子后代）反对，劝曹操停止出兵。曹操不听，孔融便在背地里发了几句牢骚。御史大夫郄虑平时与孔融不睦，得知这个情况后，便加油添酷地向曹操报告，并挑拨道：“孔融一向就瞧不起您。”“祢衡对您无理谩骂，完全是孔融指使的。”曹操一听，大怒，当即下令将孔融全家抓起来一并处死。
孔融被捕时，家中里里外外的人一个个害怕得不行，但是他的两个八、九岁的孩子却在那儿玩琢钉的游戏，没有一点惶恐的样子。家人以为孩子不懂事，大祸临头还不知道，便偷偷地叫他们赶快逃跑。孔融也对执行逮捕任务的使者恳求说：“我希望只加罪于我本人，两个孩子能不能保全？”不料两个孩子竟不慌不忙地说：“爸爸，你不要恳求了，他们不会放过我们的，覆巢之下，安有完卵？恳求有什么用？”结果，两个孩子从容不迫地和父亲一起被抓去处死。
后人即以“覆巢之下，焉有完卵”作成语用，比喻整体遭殃，个体（或部分）亦不能保全。